長崎県の一人当たり課税対象所得は296.9万円で、 全国39位／47都道府県。全国平均（328.7万円）を 31.8万円下回っています。 県内で最も高いのは長与町の343.2万円です。
| 順位 | 市区町村 | 一人当たり（万円） | 納税義務者数 |
|---|---|---|---|
| 1 | 長与町 | 343.2 | 18,620 |
| 2 | 長崎市 | 312.1 | 175,521 |
| 3 | 大村市 | 305.6 | 44,698 |
| 4 | 時津町 | 305.4 | 12,901 |
| 5 | 対馬市 | 305.1 | 11,742 |
| 6 | 諫早市 | 299.3 | 59,655 |
| 7 | 佐世保市 | 297.7 | 105,493 |
| 8 | 新上五島町 | 287.6 | 6,938 |
| 9 | 佐々町 | 287.0 | 6,354 |
| 10 | 五島市 | 274.1 | 13,613 |
| 11 | 川棚町 | 270.7 | 5,771 |
| 12 | 平戸市 | 266.6 | 11,282 |
| 13 | 島原市 | 266.6 | 16,967 |
| 14 | 壱岐市 | 261.5 | 9,169 |
| 15 | 小値賀町 | 259.7 | 757 |
| 16 | 松浦市 | 258.8 | 8,818 |
| 17 | 波佐見町 | 257.4 | 6,167 |
| 18 | 雲仙市 | 255.7 | 16,310 |
| 19 | 西海市 | 255.0 | 10,666 |
| 20 | 東彼杵町 | 253.3 | 3,058 |
| 21 | 南島原市 | 249.1 | 15,615 |
出典：総務省「市町村税課税状況等の調」（e-Stat「統計でみる市区町村のすがた」より集計）。政府標準利用規約2.0。